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但是实际操作的情况是，物流企业成本中的路桥收费不在抵扣范围，燃油费开增值税发票非常困难，经常拿不到。这两块主要成本无法抵扣，只能承担增加的税负。
郭宏表示，“营改增”的宏观意义和微观问题是并存的，在微观层面部分行业企业面临税负增加，可以借鉴此前试点城市的做法，对行业进行适当补贴。
5%的企业税负或有增加但会逐月下降
采访中，记者了解到，从之前的试点地区看，改革初期税负增加的企业大约占试点企业的5%。这些企业税负增加，主要与试点面小、地区少造成抵扣不足以及企业经营周期有关，随着试点在全国推开，可抵扣范围扩大，以及资产进入更新期，这些企业的增负程度会下降，甚至减负。上海的情况就是一个例子，试点初期增负较多的交通运输业一般纳税人增税面逐月下降，并于7月份实现全行业减税。
当然，增负企业特别是交通运输企业也要主动适应改革，加快转变经营方式，加强内部管理；可以采取统一结算、统一到可以开具增值税发票的地方领卡加油等措施，增加企业纳税抵扣，降低税收负担。当然，试行后，河北省对省内燃油零售企业，推广集中办卡开票、ETC缴费开票等办法也将试行，或会缓解因进项发票难以取得导致的企业税负增加问题。
“营改增”后税负下降是主流
“营改增”后，交通运输业的税率变成11%，现代服务业的税率为6%(除有形动产租赁服务以外)，此前缴纳的营业税税率分别是3%和5%，简单对比这不是增加了纳税人的税收负担吗？
但事实上，来自财税管理部门和试点企业的最新信息显示，试点地区小规模纳税人税负有较大幅度下降，大部分一般纳税人税负是略有下降的，现有增值税一般纳税人的税负也因进项税额抵扣范围增加而普遍降低。
对于除有形动产租赁之外的现代服务业而言，符合“营改增”试点范围小规模纳税人条件的，缴纳税额从改革前的5%营业税直接降低为改革后的3%的增值税征收率，税负下降幅度达到了40%左右，税负明显减轻。
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